Kostel Nejsvětější Trojice v Malšicích je římskokatolický farní kostel vystavěný jako vrcholně gotická jednolodní stavba ve 2. polovině 14. století a přestavěný v barokním slohu v letech 1743–1745. Nachází se na návsi obce Malšice, v okrese Tábor v Jihočeském kraji.
